hab kurz noch nach was allgemeinem zu mencoder bei Google gesucht und fand die Anregung, doch mal beide Filter mit Komma verbinden, also so:
mencoder ............... -vf expand=0:-2:0:0,crop=720:576:0:2 ................
Damit gehts dann :))
Schade nur, dass diese Syntax in der Manpage nicht erwähnt wird.